Martin Keller wurde am 25. April 1956 in Luzern geboren.
Nach der Schulzeit in Luzern liess er sich an den Konservatorien Luzern und Winterthur zum Gitarristen ausbilden und war als Musiklehrer tätig. 1983 begann er auf dem zweiten Bildungsweg Theologie zu studieren, zuerst an der Kirchlich-Theologischen Schule Basel, später an der Universität Basel. 1995 promovierte er im Fach Altes Testament an der Universität Basel. Von 1996-1997 war er Dozent für Altes Testament und Biblisches Hebräisch am Morija Theological Seminary of The Lesotho Evangelical Church in Lesotho. Von 1998-2020 war er Gemeindepfarrer in der Reformierten Kirchgemeinde Buchs-Rohr und von 2007-2020 Kirchenrat der Reformierten Landeskirche des Kantons Aargau.
Sein besonderes Interesse gilt der Mystik, einer Form der Spiritualität, in der es um kontemplative Tiefenerfahrungen und spirituelle Wachstumsprozesse geht. Von 2004-2007 absolvierte er eine Weiterbildung in geistlicher Begleitung, die er in regelmässigen Vertiefungskursen fortführt. Von 2012-2016 besuchte er den Seminarzyklus „Das Integrative Enneagramm“, ein psycho-spiritueller Weg, der alle Ebenen des Menschseins einbezieht, die mentale und emotionale, wie auch die körperliche und spirituelle.